Франц Беккенбауэр скорбит в связи со смертью сына Штефана, который умер в ночь на субботу, 01.08.2015, после продолжительной болезни в возрасте 46 лет. Об этом объявили семья Беккенбауэр и команда Bayern München в совместном заявлении для прессы. Штефан Беккенбауэр в течение многих лет был тренером молодежной команды ФК „Бавария“. У него осталась жена и трое сыновей.
В 2012 году после одиннадцати лет работы Штефан Беккенбауэр прекратил тренировать 17-летних юниоров ФК „Бавария“. После этого он занимался поиском молодых талантов. Беккенбауэр выступал в Бундеслиге за команду 1. FC Saarbrücken, а также играл за 1860 München и в качестве любителя – за „Баварию“.
Штефан Беккенбауэр является старшим из пяти детей Франца Беккенбауэра. Он единственный ребенок в семье, кто стремился сделать спортивную карьеру. Однако из-за выдающегося отца это было для него непросто.